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C-核苷药物化学合成方法的最新进展

C-核苷药物化学合成方法的最新进展


自20世纪50年代发现以来,C-核苷一直引起生物学家和药物化学家的兴趣。在这方面,C-核苷及其合成类似物已经在药物设计中产生了有希望的领先优势。同时,化学合成的进步促进了结构多样性和药物发现的努力。在这方面,趋同和模块化的合成方法引起了很多关注。其中C1'的亲核取代已经广泛应用,提供了合成的灵活性,良好的产率,操纵立体化学的能力以及结合结构修饰。在这篇综述中,我们描述了关于C-核苷的模块合成的最新报道,其重点是D-核糖内酯和糖修饰,其导致有效的铅分子。

关键词: C-核苷; 收敛合成; 模块化合成


核酸构成了所有生物体的遗传蓝图,并参与了广泛的细胞功能[1-9]对其化学结构的修饰可对酶,细胞和超分子复合物的结构和功能产生深远影响[10-22]核酸由单体核苷单元组成,其特征在于与戊糖相连的芳香含氮部分(核碱基),而戊糖又与磷酸基团连接(图1[7]戊糖和核碱基通过与糖氧相邻的碳 - 氮键连接,产生半缩醛胺键,也称为糖苷键。


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图1: 核酸的结构组分。显示的是核酸的单体结构单元。核苷酸结构的改变可以影响分子识别,以及结构和功能。

由于它们在许多生物过程中的关键作用,核苷结构的修饰已被广泛用于药物设计,尤其是在病毒学和癌症研究领域[13-15]核苷支架的变化通常通过官能团或原子的插入,缺失或转位来实现[23-29]这种修饰核苷的不同性质来自氢键基序的变化,电子效应,疏水相互作用,酸碱性质和化学反应性[25-37]一种这样的修饰是糖苷键性质的变化[29,37]

尽管糖苷键在生理条件下是稳定的,但键的断裂是常见的并且高度依赖于核碱基的性质和局部pH。此外,嘌呤的糖苷键裂解速率高于嘧啶[38-44]此外,2'-脱氧核糖核苷中的糖苷键对裂解的敏感性高于相应的核糖核苷[38-41,43]通过降低pH和酶来增强糖苷(C-N)键裂解的速率,这改变了局部酸碱环境[31,35,36]C-N键裂解通过激活攻击C1'的亲核试剂或通过稳定离去基团来进行,离去基团可以是核碱基或氧代羰基离子[31,36]因此,氧代羰基离子是在糖苷键裂解期间形成的物质,其可以作为中间或过渡态存在,这取决于糖环上正电荷的累积(图2)。结果,核碱基 - 糖连接性(C-N)的任何变化都会影响氧代羰基离子的形成,从而影响核苷类似物的稳定性(或不稳定性)。


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图2: 核苷中糖苷键裂解过程中氧代羰基离子的形成[31]离去基团稳定化和接近亲核试剂的程度决定了糖环上的电荷积累。协同过程导致图中所示的过渡态类物质,而正电荷的更大积累导致氧代羰基离子中间体。

用O-C-C键取代规范核苷的半缩醛胺(O-C-N)连接(图3),得到一类称为“C-核苷”的化合物[45-51]对C-C-C连接性的进一步修饰导致“碳环C-核苷”(图3[52,53]C-核苷具有(杂)芳基芳基,例如9-脱氮嘌呤,嘧啶,吡啶和通过C-C键与糖(或糖模拟物)连接的苯基,如图4 所示[30,45-47,50] ,54-57]糖苷键性质的变化伴随着i)增加的水解稳定性,ii)改变的氢键基序,和iii)改变的分子识别性质[25,29,37,58]由于这些变化,C-核苷已经用于研究RNA和DNA加工酶,以及药物设计工作和新型超分子结构[12,29,59]


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图3: 核碱基 - 糖连接的结构修饰。核碱基和糖之间的O-C-N键定义了糖苷键。用碳取代核碱基氮导致C-核苷。取代糖氧的碳(CH 2)产生碳环核苷。当糖苷键中的杂原子都被碳取代时,所得化合物称为碳环C-核苷。

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图4: 天然和合成C-核苷的实例。Pseudouridine和formcycin是几种天然存在的C-核苷,正在研究它们在RNA生物学和抗生素性质中的作用。最近,合成的C-核苷,例如immucillin-H和GS-5734,已显示出对嘌呤核苷磷酸化酶(PNP)和广谱抗病毒活性的有效活性



Pseudouridine是一种天然存在的C-核苷,最早在20世纪50年代被发现[45-47,50]随后,发现了更多的C-核苷并评估了它们的药用性质(图4[18,29,37,45-50,60-62]由于多年来合成方法的进步,C-核苷的所有组成部分已经扩展并且使得能够发现临床上有用的分子。一些已经进入临床评估的更重要的生物活性类似物包括Schramm等人开发的immucillins和Gilead的抗病毒吡咯并[2,1 f ]三嗪C-核苷(GS-5734和GS-6620)[32, 63-65]因此,本综述试图在过去几年中捕获C-核苷的合成努力和随后的药物发现的进展。在第一部分中,讨论了D-核糖内酯亲核取代的结构和立体化学基础,这种方法已得到广泛应用。接下来,我们描述了不同应用和结构变体的报告,这些应用和结构变体扩展了C-核苷的多样性。最后,我们讨论了碳环C-核苷的模块化合成方法,该方法也基于核糖内酯的亲核取代。

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