PROTAC研发是高度化学密集型工作。从E3配体合成到连接子优化，从靶蛋白配体改造到完整分子组装，每个环节都需要精细的定制合成支撑。纳孚生物提供覆盖PROTAC研发全流程的化学服务。

PROTAC分子的化学构成

PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）分子由三个关键模块组成，每个模块都有独特的合成挑战：

[靶蛋白配体] — [连接子 Linker] — [E3连接酶配体]

1. E3连接酶配体

目前最常用的E3连接酶配体分为两大类：

合成特点：结构独特，批量小（10mg~500mg），纯度要求高（≥95%）。

2. 连接子（Linker）

连接子是PROTAC分子中变化最频繁的部分，直接影响三元复合物的形成效率。

合成特点：通常需同时合成5-10种不同长度的连接子变体进行SAR研究。

3. 靶蛋白配体

靶蛋白配体通常基于已知的抑制剂或配体进行改造：

• 引入活化基团：活泼氨基或羧基，用于与连接子缩合

• 引入点击化学手柄：叠氮或炔基，用于CuAAC或SPAAC连接

• 保留结合活性：修饰位点需远离靶蛋白结合面

纳孚生物PROTAC定制合成服务矩阵

服务内容与交期

质量保障体系

每批PROTAC定制产品均提供以下质量文件：

• HPLC纯度报告：纯度≥95%（个别复杂分子≥90%）

• LC-MS/HRMS质谱数据：分子量确证

• ¹H/¹³C NMR谱图：结构确认

• COA报告：批次号、重量、外观、溶解性等

生物素标记PROTAC探针

在PROTAC的机制研究阶段，生物素修饰版本（Biotin-PROTAC）是不可缺少的研究工具。

应用场景

1. 亲和力Pull-down：验证PROTAC与靶蛋白的实际结合

2. 竞争实验：确认PROTAC的细胞靶点特异性

3. 三元复合物验证：通过co-IP确认POI-PROTAC-E3复合物形成

4. 脱靶蛋白鉴定：结合质谱进行系统性脱靶分析

标记策略

从探索到交付：工作流程

需求沟通 → 结构评估与报价 → 合成路线设计 → 多步合成 → 纯化与表征 → 质检报告 → 交付
   1-2天        2-3天           1-2天       按项目周期     2-3天       1天      即时

灵活的规模

• 毫克级探索（1-10mg）：快速筛选和活性验证

• 十毫克级优化（10-100mg）：SAR研究和体内验证

• 百毫克级交付（100mg-1g）：候选化合物深入评价

为什么选择纳孚生物

1. 专业团队：有机合成博士领衔，丰富PROTAC合成经验

2. 自有实验室：从毫克级探索到克级交付的灵活规模

3. 快速响应：2-3个工作日内完成结构评估和报价

4. 全面表征：HPLC + LC-MS + NMR全套数据

5. 保密协议：严格保护客户知识产权

联系我们

纳孚生物 — 专业化合物定制合成与生物素标记服务商